De acordo com a grande quantidade de serviços dependentes do vCenter, tais como Virtual Distributed Switch, SRM, DRS, produtos da familia Aria, o vCenter Server passa a ter um papel crucial no ambiente vSphere, a VMware ja tem orientado a utilização de serviços de cluster para o próprio vCenter, veja o documento https://docs.vmware.com/br/VMware-vSphere/8.0/vsphere-availability/GUID-4A626993-A829-495C-9659-F64BA8B560BD.html

Entretando, também devemos ter o backup do vCenter Server, a recomendação é fazer o backup do vCenter Server através do “vCenter Native File-Based Backup and Restore” conforme o https://www.veeam.com/kb2328.

Reveja o documento da VMware para fazer o backup do vCenter Server apropriadamente VMware vSphere User Guide: Considerations and Limitations for Image-Based Backup and Restore 

Até mais.